2029 година. Технологиите са толкова напреднали досега, че киборгите са нещо обичайно. В допълнение, човешкият мозък може да се свърже директно с интернет.
Майор Мотоко Касунажи е офицер от Секция 9, таен елитен полицейски участък, който се занимава със специални операции, включително борба с тероризма и престъпленията в кибернетичното пространство.
В момента те са по следите на кибер престъпник, който прониква в мозъците на киборгите, за да получи информация и да извърши други престъпления.