Фондът ПУДООС (Предприятие за управление на дейностите по опазване на околната среда) към екоминистерството е одобрил проект, който няма нищо общо с екологията, за друг е платил два пъти, работил е без вътрешни правила. Това е записано в одитния доклад на Сметната палата за 2004 - 2009 г., с който "Дневник" разполага. Самата палата също предостави на "Дневник" доклада, но изключвайки текстовете, изпратени в прокуратурата за проверка, както изисква законът. От разликата между двата текста може да се съди, че на прокуратурата са предадени три случая.

Единият е за проект на община Несебър, финансиран от фонда, въпреки че не влиза в обекта на дейността му. Решението е било взето еднолично от бившия министър на околната среда Джевдет Чакъров в нарушение на правилата за работа на фонда. Става дума за авариен ремонт на главен водопровод от деривация "Камчия" до Несебър, направен през 2006 г. Ремонтът на водопровода е бил възложен на регистрираното в Хасково Гражданско дружество "Консорциум монолит – ВКС" и е струвал около 8.4 милиона лева на министерствата на регионалното развитие, на околната среда и на община Несебър. По финансовото споразумение от 28 юни 2006 г. Джевдет Чакъров се е ангажирал да осигури дела на ековедомството чрез ПУДООС. Два дни по-късно фондът с протокол "по изключение" е отпуснал 1 674 088 лв.

Пречиствателната станция за отпадните води на Созопол е другият случай, който прокуратурата вероятно ще разследва. До май 2007 г. по договора с общината ПУДООС е отпуснал 1 849 580 лв. за извършеното до онзи момент строителство и се ангажира няколко месеца по-късно да разплати оставащите по договора 1 150 458 лв. Документи за оставащото финансиране не са открити, а вместо това в края на 2008 г. фондът е сключил нов договор с община Созопол за изграждане на същия обект. Още при встъпването си в длъжност миналата година новото ръководство на екоминистерството обяви, че има проекти, финансирани по няколко пъти.

Третият случай със сериозни нарушения е проект на община Родопи за канализация на с. Крумово. Общината е кандидатствала за финансиране в ПУДООС в началото на 2005 г. Поисканото финансиране за проекта "Главен колектор I" е било 1 252 364 лв. Решението за финансирането е взето 2 години по-късно и фондът е отпуснал 1.5 млн. лв., без да се мотивира защо отпуска около 250 хиляди лева повече. Разминаването е било обяснено с "представена на ръка" на ръководството на фонда актуализирана сметка на общината, одобрена от кмета на Крумово.

Новата сметка обаче се отнася до два строителни обекта: Главен колектор I и външен колектор. Общината никога не е кандидатствала за въпросния външен колектор. Договорите за строителство на обектите са четири и изпълнител на всички е фирма "Тракия – РМ",  която според фирмения регистър ДАКСИ е собственост на вече бившия зам.-министър на земеделието Димитър Пейчев и съпругата му Халина Пейчева. Двата проекта са завършени с повторни обществени поръчки, при които община Родопи директно е поканила фирмата, без да аргументира избора на процедура. Нещо повече: през декември 2007 г. ПУДООС е отчел строителството за завършено и е изплатил парите. Според регистъра на обществените поръчки и документацията на община Родопи обаче двата договора са сключени от общината чак през февруари 2008 г. Това означава, че е възможно фондът да е бил подведен да плати двете завършващи поръчки, а договорите за тях между общината и "Тракия-РМ" да са фиктивни.

Много от нарушенията, констатирани от одиторите, са свързани с липсата на вътрешни правила на фонда – много решения за финансиране са взети "в оперативен порядък", т.е. без да следват поредността на кандидатстване. Срокът за одобрение на проектите варира от броени дни до около 2 години. Проектите, одобрени за финансиране от ПУДООС до юли 2009 г., са надхвърлили многократно наличните в него пари. При встъпването си в длъжност настоящият екоминистър Нона Караджова обяви, че е заварила договори за 249 млн. лв. при налични 300 хил. лв. във фонда.