В архивите на българските специални служби няма доказателства за тяхно участие в атентата срещу папа Йоан Павел Втори, се казва в съобщение до медиите на Националната следствена служба(НСлС). От следствието заявяват, че на 10 декември 1982 г. е било образувано следствено дело във връзка със съобщения в медиите, съдържащи показания на турския терорист пред италианските съдебни власти, в които обвинява българските граждани Сергей Иванов Антонов, Жельо Колев Василев и Тодор Стоянов Айвазов в съучастие в престъплението.

По време на разследването категорично е установено, че твърденията на Агджа не отговарят на истината, заявяват от НСлС. При извършените разпити от български следователи Агджа е обяснил, че Антонов, Василев и Айвазов не са съучастници в престъплението и че твърденията му са измислени.

Тримата българи не са били посочени като съпричастни и при извършените разпознавания. Тези доказателства са потвърдени и по време на съдебния процес срещу тримата в Италия. За проверка на факти, отнасящи се до връзки на Агджа с различни лица, предимно турци, от средите на терористичната организация "Сивите вълци", следствието е разменило кореспонденция, изготвило и изпратило следствени поръчки до други държави - бившата ГДР, Франция, Австрия, Швейцария и Федерална република Германия.

От следствието уточняват, че Мехмед Али Агджа е бил привлечен към наказателна отговорност за извършените от него деяния - престъпление против републиката, набедяване в извършване на опит за убийство на невинни лица, престъпление против реда на управлението, документно престъпление и подкуп. Наказателното производство срещу него обаче е било спряно поради отсъствието му от страната. На 12 юни 1991 г. следственото дело е било възобновено. В хода на допълнителното разследване са проверени архивите на българските специални служби, в търсене на доказателства за евентуалното им участие в подготовката и осъществяването на атентата. Такива не са били открити.