След серия скандални сделки за замяна на църковни земи в землището на Каварна през последните две години варненският владика Кирил вкара в имотен спор и 200 дка от Ботаническата градина край курорта Св. Константин.

Той е собственост на Софийския университет "Св. Климент Охридски". На 15 януари 2001 г. Варненската и Великопреславска митрополия получава собствеността върху 200 дка от градината с решение на поземлената комисия. Основание за претенциите на църквата към терена е твърдението, че на него някога се е намирал манастир на гръцката църковна община във Варна, а днешната православна църква се припознава като неин наследник.

 "Първо, от XIX в. насам Ботаническата градина никога не е била в ръцете на църквата, няма и каквито и да било сведения, че някога такъв манастир въобще е съществувал на това място, каза ректорът на Софийския университет проф. Иван Илчев. Другото възражение се корени в историческата практика на българската държава - тя никога не е имала добри отношения с гръцките църковни общини, за да им преотстъпва земи, било то и за духовни нужди." По думите на проф. Илчев подобни опити за посегателства към държавни земи са правени и в Асеновград, в Елхово и още редица райони, в които е имало солидно гръцко църковно влияние в миналото.

Във варненския случай обаче поземлената комисия отсъжда на църквата 2/3 от университетската ботаническа градина, определени в решението като нива от 206 357 кв.м. Веднага след това митрополията бърза да се освободи от парцела, тъй като очевидно очаква реакция, която да оспори новата й придобивка. И тя не закъснява. Само че когато университетът предявява правата си, се оказва, че земите са вече изтъргувани. По-точно заменени срещу земеделски парцели, 250 хиляди лева, лек автомобил и микробус.

Предоставя ги "Сийланд пропъртис" АД, дъщерна компания на "Сано България" АД, която предлага да поеме организационните мероприятия по снабдяването на епархийския манастир "Св.св. Константин и Елена" с акт за собственост, уреждането на отношенията със СУ и обезпечаването на сделката с всички необходими документи от общинските и държавните власти. Университетът обаче също притежава акт за собственост и това става повод той да бъде оспорван в съда от страна на акционерното дружество. "Очакваме до края на годината казусът да приключи", каза и Момчил Караджов, управляващ "Сийланд пропъртис". Според него инвеститорски проекти за спорната земя засега не са разработвани, докато не бъде ясен изходът от делото.

Обемът на бизнес проектите на Варненската и Великопреславска митрополия далеч надхвърля сферата на духовните ценности. Един от най-екстравагантните е съчетал SPA-духовно-просветно-рехабилитационен център и ваканционно селище до двореца "Евксиноград". Инвеститор е софийското дружество "Билд ресурс", собственост на "Икономическа групировка Перун" АД, където акционер е Иван Агафонов, син на скандално известния с фалита на банка "Славяни" Георги Агафонов.

През лятото на 2006 г. общинският съвет в гр. Преслав продаде на търг превърнатия в профсъюзна почивна станция някогашен манастир "Св. Пантелеймон". Варненската и Великопреславска митрополия спечели търга с предложената цена от 664 000 лв. Веднага след наддаването владиката заяви: "Спечелихме на много висока цена, 664 е номерът на звяра."

През същото лято църковното настоятелство в каварненското с. Рогачево се оказа собственик на 121 дка земя с изглед към морето. Скоро след това терен с пазарна оценка 200 000 лв. се оказа заменен за 9 дка, оценени на 20 000 лв. След смяна на няколко собственика земята бе ипотекирана срещу 200 хиляди евро.